En 1936 emigró a Argentina, donde fundó, con Gumersindo Sánchez Guisande, el Sanatorio de Avellaneda y organizó el laboratorio de Anatomía Patológica del Centro Gallego de Buenos Aires. Antonio Baltar formó parte de la logia masónica de exiliados gallegos “Antolín Faraldo” de Buenos Aires, con Luís Seoane y Arturo Cuadrado, entre otros, que promovió iniciativas editoriales y culturales y la fundación del “Fogar Galego de Anciáns”. Participó también en las tertulias del Café “Tortoni”. Entre 1956 e 1959 presidió la “Asociación Gallega de Universitarios, Escritores y Artistas” (AGUEA). Fue miembro del equipo de dirección de la editorial “Citania”, fundada por Luís Seoane y escribió artículos en gallego como “Galeguismo, folklore, política e bioloxía” o “Isaac Díaz Pardo” y, bajo el pseudónimo de “Luís Estévez”, colaboró en la revista bonaerense Galicia emigrante.